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calcul de surfaces colorées


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5 réponses à ce sujet

#1 Thibault

Thibault

    Acide nucléique

  • Membre confirmé
  • 63 messages

Posté 02 février 2013 - 02:11

Bonjour.

Dans le cadre de tipe je suis emmené à mesurer la surface de racines mycorhizées au microscope.
Une fois prête, j'obtiens une préparation en deux couleurs : incolore pour la racine et bleu pour les zones contenant des endomycorhizes. Mon protocole utilise une réticule en grille (je compte les cases blanches et bleues).
Ma question est la suivante : Ne serrait pas possible de prendre des photos et d'automatiser ce comptage par ordinateur ?
si quelqu'un avait le nom d'un logiciel (gratuit) pour m'aider :blink:
  • 0

#2 Michel

Michel

    Homo sapiens microscopicus

  • Membre confirmé
  • PipPipPipPipPipPipPipPipPipPip
  • 8 671 messages

Posté 02 février 2013 - 05:10

Bonjour Thibault,

Tu trouveras ton bonheur avec Mesurim
Il fait tout çà et il est gratuit...

Bien cordialement.
  • 0

#3 Thibault

Thibault

    Acide nucléique

  • Membre confirmé
  • 63 messages

Posté 02 février 2013 - 06:20

Merci beaucoup.

J'ai fait quelques essais sur des images que j'avais déjà.
Le logiciel m'a l'air complet (bonne précision des mesures), les paramètres sont très réglables etc.
C'est parfait pour ce dont on à besoin (avec iris, je devrai arriver à faire rapidement les mesure). dirais des nouvelles ^^

J'ai aussi trouvé un "truc" avec GIMP. Mais c'est un "Truc", c'est pas prévu pour ça donc y'a des manip un peu compliquées et longues.

Amicalement.

Modifié par Thibault, 02 février 2013 - 06:46 .

  • 0

#4 Jean Marie Cavanihac

Jean Marie Cavanihac

    AUTEUR-MODERATEUR

  • Co-Admin
  • 3 264 messages

Posté 02 février 2013 - 08:03

bonjour Thibault,

Mesurim est bien, mais si tu veux pousser plus loin les calculs, je te suggère Image J du NIH américain, c'est un vrai traitement d'image scientifiques et médicales gratuit !..

amitiés,
JMC
  • 0

#5 Thibault

Thibault

    Acide nucléique

  • Membre confirmé
  • 63 messages

Posté 03 février 2013 - 10:52

Mercie à toi aussi Jean Marie.

On a essayer les deux programmes, on aura de quoi avec toutes les racines à analyser :P
Par contre serait-il possible d'avoir un mode d'emploi de ces deux programmes ?
Même s'ils sont complets, ils me semblent un peu compliqués à la première approche :blink:

En tout cas ça sera beaucoup plus rapide que le comptage avec le réticule (que j'aurais en plus du fabriquer).

Amicalement.
  • 0

#6 Michel

Michel

    Homo sapiens microscopicus

  • Membre confirmé
  • PipPipPipPipPipPipPipPipPipPip
  • 8 671 messages

Posté 03 février 2013 - 11:43

MESURIM



Utilisation de Mesurim

PDF

Un exemple

Pour Mesurim

http://artic.ac-besa...ocheQ/index.htm
http://artic.ac-besa...surim/index.htm

http://pedagogie.ac-...ure_mesurim.pdf

Et bien d'autres liens avec Google.
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