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LOGICIEL IRIS EN MICROSCOPIE - Les commentaires

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17 réponses à ce sujet

#1 Tryphon T

Tryphon T

    oooOooo

  • Membre confirmé
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  • 13 185 messages

Posté 26 août 2014 - 08:09

Bonjour Jean-Luc,

 

IRIS me semble un peu compliqué, tout tuto appliqué à la microscopie est le bienvenu.

Personnellement je ne classe pas ce type d'empilement dans la catégorie des post traitement bien qu'il y ait un moyennage après . Mais dans la catégorie prises de vues multiples comme le HDR, mais pas comme le stacking (piles focales) où il y a un gros traitement de déconvolution.

 

Amitiés.


  • 0

#2 Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

    Purgatorius

  • Membre Modérateur
  • 701 messages

Posté 27 août 2014 - 05:32

Bonsoir Tryphon,

Pour le tuto pas de problème, cependant le logiciel étant très riche il faut faire le tri parmi toutes les fonctionnalités.
Cordialement,
JL
  • 0

#3 Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

    Purgatorius

  • Membre Modérateur
  • 701 messages

Posté 05 septembre 2014 - 05:48

Bonjour,

 

Pour faire suite à la demande de Tryphon j' ai essayé de faire une synthèse de ce qu' il était possible de faire avec le logiciel IRIS pour traiter les images en microscopie;

Je commence par le préambule:

 

http://forum.mikrosc...en-microscopie/

 

 

Cordialement,

 

JL

 

P.S. Les remarques et commentaires sont les bienveus


  • 0

#4 Tryphon T

Tryphon T

    oooOooo

  • Membre confirmé
  • PipPipPipPipPipPipPipPipPipPip
  • 13 185 messages

Posté 05 septembre 2014 - 08:04

Bonjour Jean-Luc,

 

Un grand merci pour cette initiative.

 

J'ai survolé le logiciel , trop compliqué pour moi, et c'est une grosse tâche.

 

Admirativement;


  • 0

#5 pablito

pablito

    Homo sapiens microscopicus

  • Co.Admin
  • 1 289 messages

Posté 05 septembre 2014 - 08:57

Secret défense.

 

Pablo ... A une petite amie.

Elle est belle, elle a 7 ans aussi et s'appelle Oriane.

Son papa, Rémi, est féru d'astronomie.

Il est absolument pro pour l'utilisation d'iris.

 

Comme tout parents, on a sympathisés, on est même allé chez eux quelques jours en vacances à La Rochelle. Ça, Tryphon le sait.

En tout cas, j'en suis arrivé à la conclusion suivante : 

 

1. Le logiciel Iris est TRES COMPLIQUE (d'accord Tryphon)

2. Le logiciel Iris permet, en matière de réduction de bruit et de paramétrage, de répondre à des problématiques de poses longues auxquelles nous ne sommes pas confrontés en microscopie

3. à partir de X photos assez floues, le logiciel fait une photo nette, dans une logique complètement différente du stacking. Cela peut nous concerner, mais SURTOUT PAS pour les ciliés qui bougent et se déforment, ce n'est pas le cas des planètes ou des galaxies.

4. j’attends les exemples et les  chapitres de Jean Luc avec une curiosité et un intérêt total !!!

 

Pierre

 

PS j'adore regarder dans son télescope, c'est une découverte pour moi et Pablo !!!

PSS Oriane aime aussi le microscope.


  • 0

#6 Vardar

Vardar

    Ciliate lover

  • Membre Modérateur
  • 815 messages

Posté 05 septembre 2014 - 10:10

j'attends la suite avec impatience


  • 0

#7 Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

    Purgatorius

  • Membre Modérateur
  • 701 messages

Posté 06 septembre 2014 - 10:14

Bonjour Pierre,

 

C' est vrai qu 'IRIS n' est pas d' un abord facile mais une fois que l' on compris la démarche (au moins dans l' essentiel) c 'est un outil formidable pour la "manipulation d' image".

Dans les sujets suivants je montrerais ce qu' apporte la réduction de bruit et que l' on peut utiliser certaines fonctions avec des images (fixes) de sujet qui bougent.

Cordialement,

JL


  • 0

#8 Laurent-D

Laurent-D

    Procaryote

  • Membre confirmé
  • Pip
  • 140 messages

Posté 06 septembre 2014 - 07:36

Iris est un Bon logiciel trés puissant mais qui nécessite un apprentissage assez hard pour les novice comme pour les avertis, celui-ci est basé en grande parti sur des lignes de commande.

Par contre si vous prenez le temps de maitriser ce logiciel vous deviendrez des magiciens !

Cordialement
Laurent

Modifié par Laurent-D, 06 septembre 2014 - 07:38 .

  • 0

#9 pablito

pablito

    Homo sapiens microscopicus

  • Co.Admin
  • 1 289 messages

Posté 11 septembre 2014 - 02:00

Jean Luc

 

Je ne m'explique pas la variation de couleur sur le dernier exemple.

Sur les deux premiers, le gain n'est pas si évident.

 

Pierre


Modifié par pablito, 11 septembre 2014 - 02:00 .

  • 0

#10 Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

    Purgatorius

  • Membre Modérateur
  • 701 messages

Posté 12 septembre 2014 - 05:49

Bonsoir Pierre,

Pour l' écaille papillon je me suis trompé de fichier, j' ai rajouté le bon fichier le gain est plus évident.
Pour la variation de couleur sur le dernier exemple c' est l' image telle quelle apparait après addition.
Dans la suite tu verras que la variation de couleur va disparaître.
En fait j' expose les fonctions du logiciel dans une suite logique tel qu' on l' utiliserait pour traiter des images astro et en faisant abstraction des fonctions spécifiques quand on est dans le cadre de l' imagerie astro...... J' espère avoir été clair ?
Cordialement
JL
  • 0

#11 Tryphon T

Tryphon T

    oooOooo

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  • 13 185 messages

Posté 12 septembre 2014 - 06:00

Jean-Luc,

 

<je me suis trompé de fichier,> : l'erreur est corrigée. 


  • 0

#12 Jean Marie Cavanihac

Jean Marie Cavanihac

    AUTEUR-MODERATEUR

  • Co-Admin
  • 3 264 messages

Posté 12 septembre 2014 - 06:42

bonsoir,

 

la cela devient un peu compliqué quand on lit les posts du présent sujet  : les commentaires font référence à des images qui ne sont pas dans ces posts (de commentaires...) je me demande Si l' étiquette  " Exposé" sur l'autre sujet  Iris correspond bien au contenu  d'un exposé ?? Pour moi il s'agit plutôt d'exemples d'Iris et non d'exposé de présentation du logiciel ??

 

amitiés,

JMC


  • 0

#13 Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

    Purgatorius

  • Membre Modérateur
  • 701 messages

Posté 19 septembre 2014 - 02:35

Bonjour,

 

En fait dans l' exposé actuel j' explique les techniques utilisées en astro qui paraîssent intéressantes pour améliorer les images en microscopie; pour cela je les teste avec le logiciel IRIS. Par la suite je ferais un tuto pour IRIS.

Cordialement,

JL


  • 0

#14 Tryphon T

Tryphon T

    oooOooo

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  • 13 185 messages

Posté 04 octobre 2014 - 03:45

Bravo à Jean-Luc pour cette magnifique démonstration !

 

Vous pouvez mettre ici vos propres résultats basés sur ce tutoriel.

Je rappelle que IRIS est gratuit, cela ne coûte donc rien d'essayer, avec en plus la marche à suivre.

 

Peut-être pourrais-tu mettre le script que tu as employé, manière de vérifier directement la manip... ?

 

Merci


  • 0

#15 Eildosa

Eildosa

    Procaryote

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  • 136 messages

Posté 06 avril 2017 - 08:05

Mais ça a l'air génial. pour les sujet immobile en tous cas.

J'ai découvert ça ce matin en regardant les technique d'astronomie juste après avoir regarder un documentaire sur la lune je

suis étonnée que cette technique ne soit pas plus utilisée en microscopie.

Comment est appelé le compositage en anglais?


  • 0

#16 Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

Jean-Luc Bethmont (Picroformol)

    Purgatorius

  • Membre Modérateur
  • 701 messages

Posté 06 avril 2017 - 08:34

Je crois que c' est stacking. Voici la version en anglais:
http://www.astrosurf...s/iris/iris.htm
Sinon certaines fonctions peuvent- être transposées facilement en Python
  • 0

#17 Eildosa

Eildosa

    Procaryote

  • Membre confirmé
  • Pip
  • 136 messages

Posté 10 avril 2017 - 08:57

Oui ba en fait bof, je voulais m'en servir pour les fort grossissements mais a chaque photo les vibration deplace un peu le sujet.
 


  • 0

#18 Claude Brezisky

Claude Brezisky

    Reptile

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  • 659 messages

Posté 11 avril 2017 - 07:42

Bonsoir,

 

Oui ba en fait bof, je voulais m'en servir pour les fort grossissements mais a chaque photo les vibration deplace un peu le sujet.

C'est simple, fait un film avec le déplacement lent en continu et tu extrait les photos.

Cordialement

Claude


  • 0





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